Baseado no artigo Adding a new SSH key to your GitHub account vou explicar aqui como usar o xclip para copiar o conteúdo de um arquivo para a área de transferência.

$ sudo apt-get install xclip

Copiando o id_rsa.pub.

$ xclip -sel clip < ~/.ssh/id_rsa.pub

Depois é só pressionar Ctrl+V em qualquer lugar.